#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 20, 2024; 3:27 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Scheel B.M., & Hausdorf B. 2012. Survival and differentiation of subspecies of the land snail Charpentieria itala in mountain refuges in the Southern Alps. Molecular Ecology, 21(15): 3794–3808. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12229] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=51; TAXLABELS Charpentieria_itala_albopustulata_Anfo_1336 Charpentieria_itala_albopustulata_Baitoni_1217 Charpentieria_itala_albopustulata_Bondone_1219 Charpentieria_itala_albopustulata_Passo_della_Presolana_1289 Charpentieria_itala_albopustulata_Perledo_Riva_di_Gittana_1115 Charpentieria_itala_albopustulata_Perledo_Riva_di_Gittana_1286 Charpentieria_itala_albopustulata_Perledo_Riva_di_Gittana_1292 Charpentieria_itala_albopustulata_San_Michele_1347 Charpentieria_itala_albopustulata_San_Michele_1348 Charpentieria_itala_albopustulata_Tenno_1334 Charpentieria_itala_albopustulata_Wien_1191 Charpentieria_itala_allatollae_Molina_di_Ledro_1343 Charpentieria_itala_allatollae_Val_dAmpola_Albergo_Alla_Tolla_1358 Charpentieria_itala_allatollae_Val_dAmpola_Albergo_Alla_Tolla_1359 Charpentieria_itala_allatollae_Val_dAmpola_tow._Tremalzo_1235 Charpentieria_itala_allatollae_Val_di_Lorina_ab._Rio_Gardonera_1313 Charpentieria_itala_baldensis_Malcesine_1218 Charpentieria_itala_baldensis_Malcesine_1233 Charpentieria_itala_balsamoi_Serina_1112 Charpentieria_itala_balsamoi_Serina_1284 Charpentieria_itala_balsamoi_Serina_1295 Charpentieria_itala_braunii_Franzensfeste_1367 Charpentieria_itala_clavata_Colle_di_Balisio_1113 Charpentieria_itala_clavata_Colle_di_Balisio_1293 Charpentieria_itala_clavata_Colle_di_Balisio_1294 Charpentieria_itala_clavata_Pasturo_1377 Charpentieria_itala_clavata_Pasturo_1378 Charpentieria_itala_latestriata_Algua_Tiberio_1360 Charpentieria_itala_latestriata_Pasturo_1116 Charpentieria_itala_lorinae_Bocca_di_Valle_1220 Charpentieria_itala_lorinae_Bondone_1222 Charpentieria_itala_lorinae_Fastaggio_di_Sopra_1234 Charpentieria_itala_lorinae_Fastaggio_di_Sopra_1315 Charpentieria_itala_lorinae_Fastaggio_di_Sopra_1323 Charpentieria_itala_lorinae_Magasa_1350 Charpentieria_itala_lorinae_Magasa_1354 Charpentieria_itala_lorinae_Val_di_Lorina_1221 Charpentieria_itala_lorinae_Val_di_Lorina_1319 Charpentieria_itala_rubiginea_Mendel_Pass_1366 Charpentieria_itala_rubiginea_San_Romedio_1370 Charpentieria_itala_trepida_Rifugio_Rosa_Baremone_1216 Charpentieria_itala_trepida_Rifugio_Rosa_Baremone_1331 Charpentieria_itala_variscoi_San_Giovanni_Bianco_1114 Charpentieria_itala_variscoi_San_Giovanni_Bianco_1291 Charpentieria_itala_variscoi_San_Giovanni_Bianco_1376 Charpentieria_ornata_Badl_1151 Charpentieria_ornata_Stift_Rein_1118 Charpentieria_stenzii_cincta_Passo_del_Predil_1119 Charpentieria_stenzii_stenzii_San_Romedio_1183 Mauritanica_perinni_polygyra_Jebel_Zaghouan_1176 Siciliaria_paestana_paestana_Lago_del_Matese_1364 ; END; BEGIN TREES; TITLE Charpentieria_16S_rDNA; LINK TAXA = Taxa; TREE 'Charpentieria_16S_rDNA' = [&R] ((Mauritanica_perinni_polygyra_Jebel_Zaghouan_1176:0.3076668854032433,Siciliaria_paestana_paestana_Lago_del_Matese_1364:0.4207315630866284)100:0.3435740749427042,((Charpentieria_stenzii_stenzii_San_Romedio_1183:0.4575002368516734,Charpentieria_stenzii_cincta_Passo_del_Predil_1119:0.5417939714893948)68:0.17051171417953148,((Charpentieria_ornata_Stift_Rein_1118:0.0059395489497728205,Charpentieria_ornata_Badl_1151:2.40133183176003E-6)100:0.807940387612092,(Charpentieria_itala_lorinae_Fastaggio_di_Sopra_1234:0.32027996452070284,((((Charpentieria_itala_variscoi_San_Giovanni_Bianco_1291:0.011358837285419882,(Charpentieria_itala_variscoi_San_Giovanni_Bianco_1114:2.40133183176003E-6,Charpentieria_itala_variscoi_San_Giovanni_Bianco_1376:2.40133183176003E-6)100:0.06744186242442776)100:0.1328326096741669,(Charpentieria_itala_balsamoi_Serina_1284:0.0059768776376916,(Charpentieria_itala_balsamoi_Serina_1112:0.003781078820875205,Charpentieria_itala_balsamoi_Serina_1295:2.40133183176003E-6)93:0.003524334626747592)100:0.0652023896909834)100:0.3530569743312925,(((Charpentieria_itala_clavata_Colle_di_Balisio_1293:2.40133183176003E-6,Charpentieria_itala_clavata_Colle_di_Balisio_1294:2.40133183176003E-6)100:2.40133183176003E-6,(Charpentieria_itala_clavata_Pasturo_1377:2.40133183176003E-6,Charpentieria_itala_clavata_Pasturo_1378:2.40133183176003E-6)100:0.013393508480768566)100:0.2779522664056735,(Charpentieria_itala_allatollae_Molina_di_Ledro_1343:0.336688668314235,(Charpentieria_itala_rubiginea_Mendel_Pass_1366:0.26238988440644445,((Charpentieria_itala_rubiginea_San_Romedio_1370:0.034001935174723504,(Charpentieria_itala_braunii_Franzensfeste_1367:0.007027923808857558,Charpentieria_itala_albopustulata_Wien_1191:0.01840149762749027)92:0.017653489851253198)100:0.16391034743579141,(Charpentieria_itala_albopustulata_Tenno_1334:0.10617344950346969,(Charpentieria_itala_baldensis_Malcesine_1218:0.006653222089153062,Charpentieria_itala_baldensis_Malcesine_1233:0.009304557400135497)100:0.0746781180881195)100:0.12067240696297629)66:0.04479812888492819):0.024992405596427677)62:0.020401992901710662)37:0.026266525318171245)25:0.009083290221738519,(((Charpentieria_itala_albopustulata_Perledo_Riva_di_Gittana_1115:0.006892056282389442,Charpentieria_itala_albopustulata_Perledo_Riva_di_Gittana_1292:0.01069406954076582)100:0.08175228226785916,(Charpentieria_itala_latestriata_Pasturo_1116:0.057641740461139394,(Charpentieria_itala_albopustulata_Perledo_Riva_di_Gittana_1286:0.010672853818620504,Charpentieria_itala_latestriata_Algua_Tiberio_1360:8.199432286050788E-4)100:0.052515650138705454)99:0.044539786116495096)100:0.16898952250560306,(((Charpentieria_itala_trepida_Rifugio_Rosa_Baremone_1216:0.0037459782548201633,Charpentieria_itala_trepida_Rifugio_Rosa_Baremone_1331:0.0018598137372544791)100:0.023926010360835668,(Charpentieria_itala_albopustulata_Passo_della_Presolana_1289:0.020377636774532065,(Charpentieria_itala_clavata_Colle_di_Balisio_1113:0.043834416017817734,(Charpentieria_itala_allatollae_Val_di_Lorina_ab._Rio_Gardonera_1313:0.020737885845003478,(Charpentieria_itala_albopustulata_Anfo_1336:0.0018682000177451183,(Charpentieria_itala_albopustulata_Baitoni_1217:2.40133183176003E-6,Charpentieria_itala_albopustulata_Bondone_1219:2.40133183176003E-6)62:2.40133183176003E-6)100:0.04069309027829411)36:0.0037297972259381)38:0.0026346093417526)58:0.008240863301175749)100:0.14977455092383304,((Charpentieria_itala_allatollae_Val_dAmpola_tow._Tremalzo_1235:0.008757042244793924,Charpentieria_itala_allatollae_Val_dAmpola_Albergo_Alla_Tolla_1358:0.007016922659107218)96:0.08273406583500126,((Charpentieria_itala_albopustulata_San_Michele_1347:0.009424854750420052,Charpentieria_itala_albopustulata_San_Michele_1348:3.376140016923964E-5)100:0.049712038000485334,((Charpentieria_itala_lorinae_Val_di_Lorina_1319:0.01744248240826007,(Charpentieria_itala_allatollae_Val_dAmpola_Albergo_Alla_Tolla_1359:0.023566703857424227,(Charpentieria_itala_lorinae_Fastaggio_di_Sopra_1315:2.40133183176003E-6,Charpentieria_itala_lorinae_Fastaggio_di_Sopra_1323:0.0018835320936087356)100:0.012061104611689945)73:0.0038856772721371714)95:0.012744265360627687,((Charpentieria_itala_lorinae_Magasa_1350:0.005719789069870473,Charpentieria_itala_lorinae_Magasa_1354:2.40133183176003E-6)100:0.01292814558320564,(Charpentieria_itala_lorinae_Bocca_di_Valle_1220:0.0038212995929765414,(Charpentieria_itala_lorinae_Bondone_1222:2.40133183176003E-6,Charpentieria_itala_lorinae_Val_di_Lorina_1221:2.40133183176003E-6)88:2.40133183176003E-6)100:0.03906399383881888)57:0.007530374981023514)97:0.03205209322153662)72:0.013088978822970596)96:0.08625803888456304)66:0.02068820159016668)83:0.0599386813641185)21:0.13896173347572588)61:0.4001349989637283)100:0.15615448153637096)54:0.3435740749427042); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr50398] END;