#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 21, 2024; 13:33 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Nagel J.H., Gryzenhout M., Slippers B., Wingfield M.J., Hardy G.E., Stukely M., & Burgess T.I. 2013. Characterization of Phytophthora hybrids from ITS clade 6 associated with riparian ecosystems in South Africa and Australia. Fungal Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12996] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=55; TAXLABELS Phytophthora_amnicola_CBS131652 Phytophthora_amnicola_VHS19503 Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37727_A Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37727_PG Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37728_A Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37728_PG Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37729_A Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37729_PG Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37730_A Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37730_PG Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_MUCC774_A Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_MUCC774_PG Phytophthora_fluvialis_CBS129424 Phytophthora_fluvialis_VHS17350 Phytophthora_fragariae_PFF309_DQ092832 Phytophthora_gonapodyides_MUCC761 Phytophthora_gonapodyides_MUCC776 Phytophthora_litoralis_CBS127953 Phytophthora_litoralis_VHS17085 Phytophthora_megasperma_DDS3432 Phytophthora_megasperma_VHS17183 Phytophthora_taxon_PgChlamydo_DDS3753 Phytophthora_taxon_PgChlamydo_IMI389731 Phytophthora_taxon_PgChlamydo_SLPA121 Phytophthora_taxon_PgChlamydo_VHS6595 Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC777_A Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC777_PG Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC778_A Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC778_PG Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC779_A Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC779_PG Phytophthora_thermophila_VHS13530 Phytophthora_thermophila_VHS7474 Phytophthora_thermophila_X_Phytophthora__taxon_PgChlamydo_MUCC783_PG Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora__taxon_PgChlamydo__MUCC783_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora__taxon_PgChlamydo__MUCC784_PG Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora__taxon_PgChlamydo_MUCC784_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37731_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37731_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37732_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37732_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37733_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37733_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37734_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37734_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC780_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC780_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC781_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC781_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC782_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC782_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS22715_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS22715_T Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS5185_A Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS5185_T ; END; BEGIN TREES; TITLE 'ASF-like MP bootstrap consensus'; LINK TAXA = Taxa; TREE 'ASF-like MP bootstrap' = [&R] ((((Phytophthora_amnicola_CBS131652:100.0,Phytophthora_amnicola_VHS19503:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_MUCC774_A:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC777_A:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC778_A:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC779_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC780_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC781_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC782_A:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37727_A:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37728_A:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37729_A:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37730_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37731_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37732_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37733_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37734_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS5185_A:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS22715_A:100.0)97:97.0,(Phytophthora_gonapodyides_MUCC761:100.0,Phytophthora_gonapodyides_MUCC776:100.0)98:98.0,((Phytophthora_litoralis_CBS127953:100.0,Phytophthora_litoralis_VHS17085:100.0)87:87.0,(Phytophthora_thermophila_VHS7474:100.0,Phytophthora_thermophila_VHS13530:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC780_T:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC781_T:100.0,(Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_MUCC782_T:100.0,(Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37731_T:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37732_T:100.0)63:63.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37734_T:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS5185_T:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_VHS22715_T:100.0)62:62.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora__taxon_PgChlamydo__MUCC783_T:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora__taxon_PgChlamydo_MUCC784_T:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora_amnicola_CMW37733_T:100.0)97:97.0)63:63.0,((Phytophthora_megasperma_DDS3432:100.0,Phytophthora_megasperma_VHS17183:100.0)99:99.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_SLPA121:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_VHS6595:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_DDS3753:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_IMI389731:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_MUCC774_PG:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC777_PG:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC778_PG:100.0,Phytophthora_taxon_PgChlamydo_x_Phytophthora_amnicola_MUCC779_PG:100.0,Phytophthora_thermophila_X_Phytophthora__taxon_PgChlamydo_MUCC783_PG:100.0,Phytophthora_thermophila_×_Phytophthora__taxon_PgChlamydo__MUCC784_PG:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37727_PG:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37728_PG:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37729_PG:100.0,Phytophthora_amnicola_x_Phytophthora_taxon_PgChlamydo_CMW37730_PG:100.0)82:82.0)65:65.0,(Phytophthora_fluvialis_CBS129424:100.0,Phytophthora_fluvialis_VHS17350:100.0)99:99.0)100:100.0,Phytophthora_fragariae_PFF309_DQ092832:0.0)0; [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr55110] END;