#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 21, 2024; 22:15 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Kvist S., Laumer C.E., Junoy J., & Giribet G. 2013. A further contribution to the phylogeny and systematics of Nemertea: increased sampling for Hubrechtidae and Plectonemertidae, and phylum-wide barcoding gap detection. Invertebrate Systematics, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14868] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=133; TAXLABELS Amphiporidae_IZ132746 Amphiporus_formidabilis_IZ134452 Amphiporus_imparispinosus Amphiporus_lactifloreus Antalis_entalis Antarctonemertes_riesgoae_IZ134229 Antarctonemertes_valida_IZ134228 Argonemertes_australiensis Argonemertes_sp_IZ135315 Baseodiscus_cf_delineatus_IZ133729 Baseodiscus_mexicanus_IZ135321 Baseodiscus_sp_1 Baseodiscus_sp_2 Baseodiscus_unicolor_IZ132527 Baseodiscus_unicolor_IZ135323 Baseodiscus_unicolor_IZ135324 Callinera_grandis Capitella_teleta Carcinonemertes_carcinophila Carinina_ochracea Carinoma_hamanako_IZ135341 Carinoma_sp_1 Carinoma_sp_2 Carinoma_tremaphoros Cephalothrix_filiformis_1 Cephalothrix_filiformis_2 Cephalothrix_hongkongiensis_1 Cephalothrix_hongkongiensis_2 Cephalothrix_rufifrons Cephalotricidae_sp_IZ133009 Cerebratulus_lacteus Cerebratulus_leucopsis_IZ135331 Cerebratulus_marginatus Crepidula_fornicata Drepanophorus_spectabilis Emplectonema_buergeri Emplectonema_gracile Emplectonema_sp_IZ135333 Freshwater_heteronemertean Geonemertes_pelaensis_1 Geonemertes_pelaensis_2 Geonemertes_pelaensis_IZ132534 Gononemertes_parasita Hoplonemertea_sp_IZ135340 Hubrechtella_dubia Hubrechtella_ijimai_IZ135342 Hubrechtidae_sp_IZ25168 Interstitial_cephalotricid Laevipilina_hyalina Leptonemertes_cf_chalicophora Lineus_acutifrons Lineus_bilineatus Lineus_sp_IZ132744 Lineus_torquatus Lineus_viridis Malacobdella_cf_grossa_IZ25170 Malacobdella_grossa Micrura_chloropardalis_IZ132530 Micrura_dellechiajei_IZ132745 Micrura_fasciolata_1 Micrura_fasciolata_2 Micrura_ignea Micrura_ignea_IZ133720 Micrura_ignea_IZ135349 Micrura_purpurea Micrura_rubramaculosa_IZ132531 Micrura_sp_IZ132529 Micrura_sp_IZ132532 Micrura_sp_IZ133724 Micrura_verrilli_IZ134451 Monostilifera_sp_IZ133023 Nemertea_sp_IZ132533 Nemertea_sp._CAB3 Nemertea_sp._SK80 Nemertopsis_bivittata Neocrania_anomala Nipponnemertes_pulchra Nipponnemertes_sp_1 Nipponnemertes_sp_2 Notospermus_geniculatus_IZ132741 Notospermus_sp_IZ132528 Notospermus_sp_IZ133726 Notospermus_sp_IZ134234 Notospermus_sp_IZ135356 Oerstedia_sp_IZ132740 Oerstedia_sp_IZ132743 Ototyphlonemertes_cf._pallida_IZ133745 Ototyphlonemertes_correae Ototyphlonemertes_macintoshi Paradrepanophorus_crassus Paranerilla_limicola Parborlasia_corrugatus Phascolion_strombus Phoronis_hippocrepia Phoronis_vancouverensis Plectonemertidae_sp_IZ25166 Plectonemertidae_sp_IZ25167 Plectonemertidae_sp_IZ25169 Plectonemertidae_sp_IZ25173 Plectonemertidae_sp_IZ25174 Plectonemertidae_sp_IZ25175 Polystilifera_sp Potamonemertes_cf_percivali_IZ25172 Prosorhochmus_americanus Prosorhochmus_nelsoni Prostoma_cf_eilhardi Protopelagonemertes_beebei Psammamphiporus_elongatus Ramphogordius_lacteus Ramphogordius_lacteus_IZ135373 Ramphogordius_sanguineus Reptantia_sp_IZ132526 Reptantia_sp_IZ133024 Riseriellus_occultus_1 Riseriellus_occultus_2 Riseriellus_occultus_3 Sipunculus_nudus Terebratalia_transversa Tetranemertes_antonina_IZ132747 Tetrastemma_sp_132742 Tetrastemma_vittigera_132742 Tetrastemmatidae_IZ132537 Tubulanus_annulatus Tubulanus_pellucidus Tubulanus_polymorphus Tubulanus_punctatus Tubulanus_sexlineatus Urechis_caupo Vieitezia_luzmurubeae Vieitezia_luzmurubeae_IZ133740 Yoldia_limatula Zygeupolia_rubens Zygonemertes_virescens ; END; BEGIN TREES; TITLE 'Nemertea all E-INS-i for 18S and 28S'; LINK TAXA = Taxa; TREE TNT_all_e_ins_i.tre = [&R] (Terebratalia_transversa:167.5,((Neocrania_anomala:232.0,(Phoronis_vancouverensis:47.0,Phoronis_hippocrepia:34.0):107.0):45.0,((Laevipilina_hyalina:343.0,(Antalis_entalis:439.0,Yoldia_limatula:293.0):70.0):63.0,(((Crepidula_fornicata:283.0,(Capitella_teleta:457.0,Phascolion_strombus:238.0):90.0):56.0,(Paranerilla_limicola:201.0,(Urechis_caupo:139.0,Sipunculus_nudus:129.0):2.0):30.0):72.0,((((Tubulanus_annulatus:142.0,Tubulanus_polymorphus:240.0):140.0,((Tubulanus_sexlineatus:74.0,Tubulanus_punctatus:81.0):125.0,(Tubulanus_pellucidus:130.0,Callinera_grandis:171.0):285.0):62.0):97.0,(Interstitial_cephalotricid:243.0,(Cephalotricidae_sp_IZ133009:360.0,((Cephalothrix_filiformis_2:3.0,Cephalothrix_filiformis_1:3.0):140.0,(Cephalothrix_rufifrons:133.0,(Cephalothrix_hongkongiensis_2:9.0,Cephalothrix_hongkongiensis_1:1.0):113.0):58.0):82.0):56.0):215.0):85.0,((Carinina_ochracea:362.0,(Carinoma_tremaphoros:94.0,(Carinoma_sp_2:1.0,(Carinoma_sp_1:3.0,Carinoma_hamanako_IZ135341:1.0):3.0):109.0):189.0):44.0,((((Baseodiscus_cf_delineatus_IZ133729:480.0,(Baseodiscus_mexicanus_IZ135321:214.0,Baseodiscus_sp_1:127.0):55.0):78.0,(Nemertea_sp._SK80:196.0,(Baseodiscus_unicolor_IZ135323:33.0,(Baseodiscus_unicolor_IZ135324:69.0,(Baseodiscus_unicolor_IZ132527:13.0,Baseodiscus_sp_2:12.0):23.0):4.0):53.0):74.0):79.0,(Micrura_verrilli_IZ134451:214.0,((Micrura_sp_IZ132529:124.0,(Micrura_sp_IZ133724:98.0,Micrura_sp_IZ132532:192.0):89.0):127.0,((Micrura_ignea_IZ135349:0.0,(Micrura_ignea_IZ133720:6.0,Micrura_ignea:24.0):1.0):168.0,((Lineus_acutifrons:130.0,(Lineus_torquatus:137.0,Lineus_bilineatus:297.0):76.0):54.0,(((Notospermus_sp_IZ134234:107.0,Notospermus_sp_IZ132528:147.0):138.0,(Zygeupolia_rubens:175.0,Freshwater_heteronemertean:160.0):45.0):31.0,((Cerebratulus_lacteus:189.0,(Cerebratulus_marginatus:134.0,(Micrura_rubramaculosa_IZ132531:166.0,Micrura_chloropardalis_IZ132530:143.0):91.0):34.0):48.0,((Cerebratulus_leucopsis_IZ135331:194.0,((Notospermus_geniculatus_IZ132741:60.0,Notospermus_sp_IZ135356:170.0):41.0,(Micrura_dellechiajei_IZ132745:171.0,Notospermus_sp_IZ133726:418.0):67.0):76.0):34.0,(Micrura_purpurea:160.0,(Parborlasia_corrugatus:126.0,((Micrura_fasciolata_2:2.0,Micrura_fasciolata_1:0.0):82.0,((Lineus_viridis:72.0,Ramphogordius_sanguineus:82.0):49.0,((Lineus_sp_IZ132744:58.0,(Ramphogordius_lacteus_IZ135373:49.0,Ramphogordius_lacteus:74.0):22.0):49.0,(Riseriellus_occultus_3:161.0,(Riseriellus_occultus_2:1.0,Riseriellus_occultus_1:24.0):20.0):51.0):22.0):25.0):17.0):20.0):24.0):17.0):20.0):22.0):58.0):40.0):32.0):67.0):80.0,((Hubrechtella_ijimai_IZ135342:441.0,(Hubrechtella_dubia:191.0,Hubrechtidae_sp_IZ25168:179.0):57.0):54.0,((Protopelagonemertes_beebei:261.0,((Drepanophorus_spectabilis:169.0,Paradrepanophorus_crassus:120.0):35.0,(Reptantia_sp_IZ133024:72.0,(Reptantia_sp_IZ132526:85.0,Polystilifera_sp:234.0):34.0):63.0):47.0):82.0,(((Amphiporidae_IZ132746:118.0,Nemertea_sp_IZ132533:94.0):35.0,(Nipponnemertes_sp_1:56.0,(Nipponnemertes_sp_2:34.0,Nipponnemertes_pulchra:46.0):31.0):98.0):60.0,(Carcinonemertes_carcinophila:408.0,((((Argonemertes_sp_IZ135315:40.0,Argonemertes_australiensis:61.0):108.0,((Plectonemertidae_sp_IZ25173:18.0,Plectonemertidae_sp_IZ25174:29.0):130.0,((Potamonemertes_cf_percivali_IZ25172:219.0,Leptonemertes_cf_chalicophora:343.0):55.0,(Plectonemertidae_sp_IZ25175:183.0,(Plectonemertidae_sp_IZ25169:128.0,(Plectonemertidae_sp_IZ25166:3.0,Plectonemertidae_sp_IZ25167:19.0):35.0):138.0):28.0):28.0):52.0):81.0,((Tetranemertes_antonina_IZ132747:141.0,Monostilifera_sp_IZ133023:112.0):54.0,((Oerstedia_sp_IZ132740:113.0,Oerstedia_sp_IZ132743:58.0):78.0,((Prosorhochmus_nelsoni:155.0,(Antarctonemertes_valida_IZ134228:19.0,Antarctonemertes_riesgoae_IZ134229:22.0):256.0):27.0,(Gononemertes_parasita:105.0,(Nemertea_sp._CAB3:44.0,(Tetrastemma_vittigera_132742:43.0,(Vieitezia_luzmurubeae_IZ133740:6.0,Vieitezia_luzmurubeae:8.0):35.0):18.0):58.0):22.0):17.0):23.0):57.0):40.0,((Ototyphlonemertes_correae:184.0,(Ototyphlonemertes_cf._pallida_IZ133745:41.0,Ototyphlonemertes_macintoshi:22.0):172.0):57.0,((Hoplonemertea_sp_IZ135340:133.0,(Emplectonema_sp_IZ135333:517.0,Zygonemertes_virescens:112.0):37.0):71.0,((Tetrastemmatidae_IZ132537:135.0,(Tetrastemma_sp_132742:62.0,Psammamphiporus_elongatus:91.0):71.0):68.0,((Emplectonema_gracile:217.0,Prostoma_cf_eilhardi:169.0):37.0,(((Malacobdella_grossa:11.0,Malacobdella_cf_grossa_IZ25170:26.0):81.0,(Geonemertes_pelaensis_IZ132534:100.0,(Geonemertes_pelaensis_2:3.0,Geonemertes_pelaensis_1:7.0):28.0):147.0):40.0,((Prosorhochmus_americanus:158.0,Nemertopsis_bivittata:148.0):51.0,(Emplectonema_buergeri:139.0,(Amphiporus_imparispinosus:98.0,(Amphiporus_formidabilis_IZ134452:50.0,Amphiporus_lactifloreus:111.0):22.0):30.0):36.0):19.0):21.0):18.0):16.0):29.0):42.0):48.0):71.0):82.0):133.0):50.0):31.0):38.0):68.0):36.0):60.0):167.5); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr69163] END;