#NEXUS

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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Bonatelli I.A., Perez M.F., Peterson A., Taylor N.P., Zappi D.C., Machado M.C., Koch
I., Pires A.H., & Moraes E.M. 2014. Interglacial microrefugia and diversification
of a cactus species complex: phylogeography and paleodistributional reconstructions
for Pilosocereus aurisetus and allies. Molecular Ecology, .

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S15695]

BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa;
        DIMENSIONS NTAX=47;
        TAXLABELS
            Arrojadoa_rhodantha
            Blossfeldia_liliputana
            Brasiliopuntia_brasiliensis
            Maihuenia_patagonica
            Parodia_maassii
            Pereskia_aculeata
            Pilosocereus_aureispinus_IBO
            Pilosocereus_aurisetus_CMO
            Pilosocereus_aurisetus_COC
            Pilosocereus_aurisetus_EDB
            Pilosocereus_aurisetus_GMO
            Pilosocereus_aurisetus_INA
            Pilosocereus_aurisetus_ITA
            Pilosocereus_aurisetus_JFE
            Pilosocereus_aurisetus_MEN
            Pilosocereus_aurisetus_ODA
            Pilosocereus_aurisetus_PJK
            Pilosocereus_aurisetus_TAT
            Pilosocereus_bohlei_UMB_1
            Pilosocereus_bohlei_UMB_2
            Pilosocereus_juaruensis_ALC
            Pilosocereus_juaruensis_AQU
            Pilosocereus_juaruensis_COX
            Pilosocereus_juaruensis_RVE_1
            Pilosocereus_juaruensis_RVE_2
            Pilosocereus_machrisii_APA1
            Pilosocereus_machrisii_APA2_1
            Pilosocereus_machrisii_APA2_2
            Pilosocereus_machrisii_ART_1
            Pilosocereus_machrisii_ART_2
            Pilosocereus_machrisii_BAR
            Pilosocereus_machrisii_BRO
            Pilosocereus_machrisii_CMB_1
            Pilosocereus_machrisii_CMB_2
            Pilosocereus_machrisii_CRI
            Pilosocereus_machrisii_DEL
            Pilosocereus_machrisii_FMS
            Pilosocereus_machrisii_FOR
            Pilosocereus_machrisii_FUR
            Pilosocereus_machrisii_POS1
            Pilosocereus_machrisii_URU
            Pilosocereus_parvus_POS2
            Pilosocereus_vilaboensis_GOV_1
            Pilosocereus_vilaboensis_GOV_2
            Pilosocereus_vilaboensis_PIR
            Quiabentia_verticillata
            Tephrocactus_turpinii
            ;
END;

BEGIN TREES;
      TITLE Bonatelli_et_al_2014_ML_BI_PhyC_1022;
      LINK TAXA = Taxa;
      TREE Fig._S2_B_ML = [&R] (Pereskia_aculeata:0.0379922064,((Brasiliopuntia_brasiliensis:0.007473103,(Quiabentia_verticillata:0.0362238327,Tephrocactus_turpinii:0.0189441805):0.0062798121):0.0374912493,(Maihuenia_patagonica:0.026253797,(Blossfeldia_liliputana:0.0274759642,(Parodia_maassii:0.0548815618,(Arrojadoa_rhodantha:0.0146058388,((Pilosocereus_bohlei_UMB_1:0.0017965006,Pilosocereus_bohlei_UMB_2:2.0E-10):0.0090664445,(Pilosocereus_aureispinus_IBO:0.0017513079,(Pilosocereus_machrisii_DEL:2.0E-10,((Pilosocereus_machrisii_APA2_1:2.0E-10,((Pilosocereus_machrisii_APA1:2.0E-10,(Pilosocereus_machrisii_CRI:2.0E-10,Pilosocereus_machrisii_APA2_2:0.0017539062):1.632E-7):1.254E-7,(Pilosocereus_machrisii_URU:2.0E-10,(Pilosocereus_machrisii_FMS:2.0E-10,(Pilosocereus_machrisii_CMB_1:2.0E-10,(Pilosocereus_machrisii_ART_2:2.0E-10,(Pilosocereus_machrisii_ART_1:2.0E-10,Pilosocereus_machrisii_CMB_2:0.0017595286):7.4E-8):1.623E-7):0.0017552109):1.005E-7):2.0E-10):7.6E-8):0.001757564,(Pilosocereus_machrisii_POS1:2.0E-10,((Pilosocereus_machrisii_FOR:2.0E-10,(Pilosocereus_vilaboensis_PIR:2.0E-10,(Pilosocereus_juaruensis_ALC:0.0017567285,(Pilosocereus_juaruensis_AQU:2.0E-10,((Pilosocereus_vilaboensis_GOV_1:0.0017568404,Pilosocereus_vilaboensis_GOV_2:2.0E-10):0.0017600028,(Pilosocereus_juaruensis_RVE_2:0.0017591553,(Pilosocereus_juaruensis_RVE_1:2.0E-10,Pilosocereus_juaruensis_COX:2.0E-10):1.374E-7):0.00175731):1.564E-7):9.595E-7):0.0017596916):0.0017544282):7.53E-8,(Pilosocereus_parvus_POS2:2.0E-10,(((Pilosocereus_machrisii_BAR:2.0E-10,Pilosocereus_aurisetus_GMO:2.0E-10):2.0E-10,(Pilosocereus_aurisetus_EDB:1.112E-7,(Pilosocereus_machrisii_BRO:2.0E-10,Pilosocereus_machrisii_FUR:2.0E-10):2.0E-10):1.292E-7):9.45E-8,((Pilosocereus_aurisetus_INA:2.0E-10,(Pilosocereus_aurisetus_JFE:0.0053068906,Pilosocereus_aurisetus_ITA:2.0E-10):1.395E-7):0.0017567365,((Pilosocereus_aurisetus_ODA:2.0E-10,Pilosocereus_aurisetus_TAT:2.0E-10):7.65E-8,(Pilosocereus_aurisetus_COC:2.0E-10,(Pilosocereus_aurisetus_CMO:2.0E-10,(Pilosocereus_aurisetus_MEN:2.0E-10,Pilosocereus_aurisetus_PJK:2.0E-10):2.0E-10):2.0E-10):0.0017083521):4.20409E-5):6.94E-8):1.462E-7):2.0E-10):1.263E-7):7.45E-8):1.557E-7):0.0017621919):0.0035828301):9.86E-8):0.0274971166):0.0074485917):0.0147911085):0.0101748499):0.0379922064);
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr74779]


END;