#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 23, 2024; 23:26 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Deng J., Drew B.T., Mavrodiev E.V., Gitzendanner M.A., Soltis P., & Soltis D. 2014. Saxifragaceae: Phylogeny, divergence times, and historical biogeography. Molecular Phylogentics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16330] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=228; TAXLABELS Astilbe_biternata Astilbe_chinensis Astilbe_grandis Astilbe_japonica Astilbe_longicarpa Astilbe_macrocarpa Astilbe_macroflora Astilbe_microphylla Astilbe_myriantha Astilbe_odontophylla Astilbe_philippinensis Astilbe_rivularis Astilbe_rubra Astilbe_simplicifolia Astilbe_taquetii Astilbe_thunbergii Astilboides_tabularis Bensoniella_oregona Bergenia_ciliata Bergenia_crassifolia Bergenia_emeiensis Bergenia_pacumbis Bergenia_purpurascens Bergenia_sp Bergenia_stracheyi Bolandra_oregana Boykinia_occidentalis Boykinia_richardsonii Boykinia_rotundifolia Cascadia_nuttallii Chrysosplenium_album Chrysosplenium_alternifolium Chrysosplenium_americanum Chrysosplenium_davidianum Chrysosplenium_echinus Chrysosplenium_fauriae Chrysosplenium_flagelliferum Chrysosplenium_grayanum Chrysosplenium_griffithii Chrysosplenium_hydrocotylifolium Chrysosplenium_iowense Chrysosplenium_japonicum Chrysosplenium_kamtschaticum Chrysosplenium_kiotense Chrysosplenium_lanuginosum Chrysosplenium_macrostemon Chrysosplenium_maximowiczii Chrysosplenium_microspermum Chrysosplenium_nagasei Chrysosplenium_nepalense Chrysosplenium_oppositifolium Chrysosplenium_pilosum Chrysosplenium_pseudofauriei Chrysosplenium_ramosum Chrysosplenium_rhabdospermum Chrysosplenium_rosendahlii Chrysosplenium_tetrandrum Chrysosplenium_tosaense Chrysosplenium_wrightii Conimitella_williamsii Darmera_peltata Elmera_racemosa Heuchera_americana Heuchera_chlorantha Heuchera_cylindrica Heuchera_elegans Heuchera_glabra Heuchera_grossulariifolia Heuchera_maxima Heuchera_merriamii Heuchera_micrantha Heuchera_parvifolia Heuchera_pilosissima Heuchera_richardsonii Heuchera_rubescens Heuchera_sanguinea Heuchera_villosa Itea_chinensis Itea_virginica Jepsonia_parryi Leptarrhena_pyrolifolia Liquidambar_formosana Liquidambar_styraciflua Lithophragma_affine Lithophragma_bolanderi Lithophragma_campanulatum Lithophragma_cymbalaria Lithophragma_glabrum Lithophragma_heterophyllum Lithophragma_parviflorum Lithophragma_tenellum Micranthes_aprica Micranthes_arguta Micranthes_bryophora Micranthes_californica Micranthes_calycina Micranthes_clusii Micranthes_ferruginea Micranthes_foliolosa Micranthes_fusca Micranthes_hieraciifolia Micranthes_howellii Micranthes_integrifolia Micranthes_lyallii Micranthes_nelsoniana Micranthes_nidifica Micranthes_nivalis Micranthes_occidentalis Micranthes_oregana Micranthes_pallida Micranthes_pensylvanica Micranthes_porsildiana Micranthes_punctata Micranthes_reflexa Micranthes_rhomboidea Micranthes_rufidula Micranthes_spicata Micranthes_stellaris Micranthes_tenuis Micranthes_texana Micranthes_virginiensis Mitella_acerina Mitella_breweri Mitella_caulescens Mitella_diphylla Mitella_diversifolia Mitella_doiana Mitella_formosana Mitella_furusei Mitella_integripetala Mitella_japonica Mitella_kiusiana Mitella_koshiensis Mitella_nuda Mitella_ovalis Mitella_pauciflora Mitella_pentandra Mitella_stauropetala Mitella_stylosa Mitella_trifida Mitella_yoshinagae Mukdenia_rosii Oresitrophe_rupifraga Peltoboykinia_tellimoides Ribes_aff._giraldii Rodgersia_aesculifolia Rodgersia_pinnata Rodgersia_podophylla Rodgersia_sambucifolia Saniculiphyllum_guangxiense Saxifraga_aizoides Saxifraga_anadyrensis Saxifraga_aspera Saxifraga_balfourii Saxifraga_biflora Saxifraga_bracteata Saxifraga_bronchialis Saxifraga_brunonis Saxifraga_bryoides Saxifraga_caesia Saxifraga_caulescens Saxifraga_cernua Saxifraga_cespitosa Saxifraga_cherlerioides Saxifraga_cochlearis Saxifraga_cuneifolia Saxifraga_cymbalaria Saxifraga_derbekii Saxifraga_diversifolia Saxifraga_eschscholtzii Saxifraga_flagellaris Saxifraga_flexuosa Saxifraga_florulenta Saxifraga_fortunei Saxifraga_funstonii Saxifraga_granulata Saxifraga_hirculus Saxifraga_hirsuta Saxifraga_hispidula Saxifraga_hostii Saxifraga_hyperborea Saxifraga_hypnoides Saxifraga_kruhsiana Saxifraga_longifolia Saxifraga_mertensiana Saxifraga_moschata Saxifraga_mutata Saxifraga_nishidae Saxifraga_opdalensis Saxifraga_oppositifolia Saxifraga_osloensis Saxifraga_paniculata Saxifraga_platysepala Saxifraga_radiata Saxifraga_rebunshirensis Saxifraga_retusa Saxifraga_rivularis Saxifraga_rosacea Saxifraga_rotundifolia Saxifraga_scardica Saxifraga_serpyllifolia Saxifraga_setigera Saxifraga_spathularis Saxifraga_spinulosa Saxifraga_squarrosa Saxifraga_stelleriana Saxifraga_stolonifera Saxifraga_strigosa Saxifraga_svalbardensis Saxifraga_taylorii Saxifraga_tricuspidata Saxifraga_tridactylites Saxifraga_vespertina Saxifragella_bicuspidata Saxifragodes_albowiana Saxifragopsis_fragarioides Suksdorfia_ranunculifolia Suksdorfia_violacea Sullivantia_oregana Sullivantia_sullivantii Tanakaea_radicans Telesonix_heucheriformis Telesonix_jamesii Tellima_grandiflora Tiarella_cordifolia Tiarella_polyphylla Tiarella_trifoliata Tolmiea_menziesii ; END; BEGIN TREES; TITLE 'Saxifragaceae cpDNA+nrDNA-BI'; LINK TAXA = Taxa; TREE 'cpDNA+nrDNA-BI' = [&R] ((((((Astilbe_macroflora:8.96E-4,Astilbe_longicarpa:0.001609):0.001402,Astilbe_japonica:0.001178):8.66E-4,(Astilbe_grandis:0.002891,(((((Astilbe_chinensis:5.56E-4,Astilbe_taquetii:0.003643):0.003366,Astilbe_rivularis:0.00455):0.001137,(((((Saxifragella_bicuspidata:0.022966,((((Saxifraga_tricuspidata:0.002163,(Saxifraga_taylorii:2.58E-4,Saxifraga_cherlerioides:6.83E-4):4.96E-4):-7.01E-4,Saxifraga_vespertina:0.043619):0.007728,(Saxifraga_bronchialis:0.009707,(Saxifraga_nishidae:0.003712,(((Saxifraga_caulescens:-6.04E-4,Saxifraga_derbekii:-5.01E-4):-5.45E-4,((Saxifraga_funstonii:0.001126,Saxifraga_stelleriana:0.001793):-7.94E-4,(Saxifraga_anadyrensis:0.001403,(Saxifraga_kruhsiana:-3.73E-4,Saxifraga_rebunshirensis:-1.45E-4):0.001685):-2.48E-4):-0.002185):0.001924,Saxifraga_spinulosa:8.53E-4):0.002626):0.001893):0.006954):0.014455,(((Saxifraga_eschscholtzii:0.01101,((Saxifraga_serpyllifolia:0.009715,(Saxifraga_diversifolia:0.0044,Saxifraga_hirculus:0.007012):0.003663):0.005305,((Saxifraga_hispidula:0.006606,((Saxifraga_platysepala:0.004892,(Saxifraga_setigera:6.8E-4,Saxifraga_flagellaris:8.94E-4):0.003755):0.003774,(Saxifraga_strigosa:0.002423,Saxifraga_balfourii:4.92E-4):0.004749):0.001341):5.36E-4,Saxifraga_brunonis:0.002561):0.001641):0.004883):0.003219,Saxifraga_cymbalaria:0.026311):0.003237,((((((((Saxifraga_granulata:0.004078,Saxifraga_hypnoides:0.001455):5.84E-4,Saxifraga_rosacea:0.005067):0.003891,(Saxifraga_cespitosa:8.4E-4,Saxifraga_moschata:0.005924):0.003142):0.011004,Saxifraga_osloensis:0.021905):0.002524,Saxifraga_tridactylites:0.022065):0.010293,Saxifraga_rotundifolia:0.004381):0.002268,(((Saxifraga_longifolia:0.006253,(((Saxifraga_hostii:0.017183,Saxifraga_paniculata:0.001125):0.002665,Saxifraga_cochlearis:0.009962):7.1E-4,Saxifraga_cuneifolia:0.005826):0.001365):0.002508,Saxifraga_hirsuta:0.002649):0.002129,(Saxifraga_florulenta:0.007637,((((((Saxifraga_scardica:0.004828,Saxifraga_spathularis:0.007882):0.005935,Saxifraga_oppositifolia:0.005181):-0.002407,Saxifraga_biflora:0.00146):3.47E-4,((Saxifraga_aizoides:0.002616,Saxifraga_mutata:0.002906):6.41E-4,(Saxifraga_caesia:0.003541,Saxifraga_squarrosa:0.00276):7.42E-4):0.001235):0.00309,(Saxifraga_bryoides:0.00211,Saxifraga_aspera:0.024212):0.030204):-2.18E-4,Saxifraga_retusa:0.005374):0.001316):0.002805):0.001395):0.001392,(((Saxifraga_cernua:0.001401,Saxifraga_radiata:0.003709):5.55E-4,(Saxifraga_flexuosa:0.003333,(Saxifraga_hyperborea:4.78E-4,((Saxifraga_rivularis:3.0E-4,Saxifraga_opdalensis:8.98E-4):7.52E-4,Saxifraga_svalbardensis:0.002386):0.001701):6.2E-4):0.001861):0.005874,Saxifraga_bracteata:0.006854):0.011587):0.007509):0.005482):0.009199):0.017972,(Saxifraga_mertensiana:0.013912,(Saxifraga_fortunei:0.036615,Saxifraga_stolonifera:0.005625):0.004862):0.010371):0.014226,(((Itea_virginica:0.001744,Itea_chinensis:0.002953):0.021387,(Liquidambar_formosana:0.009442,Liquidambar_styraciflua:0.002065):0.023981):0.004741,Ribes_aff._giraldii:0.024159):0.00788):0.001712,(((Mitella_nuda:0.005359,Mitella_diphylla:0.005797):0.002258,(((((Heuchera_elegans:0.007744,(Heuchera_rubescens:2.69E-4,Heuchera_glabra:0.007543):-8.8E-5):4.02E-4,((Heuchera_parvifolia:0.003362,(Heuchera_merriamii:1.48E-4,(Heuchera_americana:4.83E-4,Heuchera_richardsonii:0.002387):0.001427):4.29E-4):0.001102,Heuchera_grossulariifolia:0.002559):3.39E-4):0.001837,Heuchera_sanguinea:0.001774):0.001732,(((((Tiarella_cordifolia:0.002361,Tiarella_polyphylla:4.41E-4):4.39E-4,Tiarella_trifoliata:0.002156):3.77E-4,((((Mitella_diversifolia:0.00195,(Conimitella_williamsii:0.002821,Mitella_stauropetala:0.001954):4.65E-4):3.2E-4,Mitella_trifida:0.00112):0.001743,(Elmera_racemosa:0.002645,Mitella_caulescens:0.005645):0.001128):0.001292,Mitella_integripetala:0.006954):0.001498):4.22E-4,(((((Heuchera_pilosissima:0.001183,Heuchera_micrantha:2.96E-4):3.48E-4,(Heuchera_chlorantha:0.002801,Heuchera_cylindrica:5.2E-4):0.001354):4.98E-4,Heuchera_maxima:0.003572):0.001999,Heuchera_villosa:0.012268):0.00312,Tellima_grandiflora:0.0018):5.6E-4):7.52E-4,((Mitella_furusei:0.002458,(Mitella_ovalis:3.72E-4,Mitella_breweri:9.67E-4):0.007768):0.005019,(Mitella_pentandra:9.15E-4,((Mitella_yoshinagae:0.0047,Mitella_kiusiana:0.003406):0.002705,(Mitella_pauciflora:0.00381,((Mitella_formosana:0.002437,Mitella_japonica:0.006187):0.002375,(Mitella_koshiensis:0.003254,((Mitella_doiana:0.003271,Mitella_stylosa:0.001324):4.99E-4,Mitella_acerina:0.002436):5.55E-4):8.57E-4):0.004006):8.57E-4):0.001845):3.96E-4):4.78E-4):1.98E-4):5.67E-4,((((Lithophragma_tenellum:0.005585,Lithophragma_glabrum:0.001212):0.011445,(Lithophragma_affine:0.001341,Lithophragma_parviflorum:0.001112):0.003701):0.005471,(Lithophragma_campanulatum:0.008703,(Lithophragma_bolanderi:0.007922,(Lithophragma_cymbalaria:0.0069,Lithophragma_heterophyllum:0.003277):0.007076):0.002673):0.006141):0.019194,(Bensoniella_oregona:0.007411,Tolmiea_menziesii:0.003439):0.001454):0.002806):7.31E-4):0.007944,((((Micranthes_bryophora:0.021546,((Micranthes_foliolosa:0.002532,Micranthes_ferruginea:0.002932):0.001143,(Micranthes_stellaris:0.001413,Micranthes_clusii:0.001224):0.004158):0.012062):0.017439,(Micranthes_pallida:0.014218,((((Micranthes_tenuis:5.06E-4,Micranthes_reflexa:5.94E-4):0.00151,((((Micranthes_texana:0.004076,Micranthes_nivalis:0.003894):0.003318,Micranthes_pensylvanica:0.001434):0.00225,(((Micranthes_oregana:0.001844,((Micranthes_integrifolia:8.71E-4,(Micranthes_occidentalis:0.001198,Micranthes_californica:0.001203):0.001354):0.001071,Micranthes_rufidula:0.001462):1.94E-4):7.15E-4,Micranthes_aprica:0.001867):5.53E-4,(Micranthes_rhomboidea:0.001681,Micranthes_nidifica:0.006364):0.002273):8.58E-4):4.8E-4,((Micranthes_virginiensis:0.004179,(Micranthes_howellii:0.012366,Micranthes_lyallii:0.003312):0.002139):7.93E-4,Micranthes_hieraciifolia:0.00309):0.001077):8.44E-4):0.007073,Micranthes_arguta:0.013413):0.002859,(Micranthes_spicata:0.01071,((Micranthes_punctata:0.004623,Micranthes_fusca:0.00297):0.003988,(Micranthes_calycina:0.002051,(Micranthes_nelsoniana:0.041727,Micranthes_porsildiana:0.002408):0.009306):0.002271):0.002212):0.004186):0.004072):0.002185):0.021006,(Peltoboykinia_tellimoides:0.011072,((((Chrysosplenium_japonicum:0.007241,(((Chrysosplenium_alternifolium:0.001399,Chrysosplenium_iowense:8.93E-4):2.59E-4,Chrysosplenium_rosendahlii:6.38E-4):7.85E-4,(Chrysosplenium_tetrandrum:0.002097,Chrysosplenium_wrightii:0.002816):0.00203):0.002013):0.00591,(((Chrysosplenium_lanuginosum:0.010076,Chrysosplenium_davidianum:0.002792):0.002489,Chrysosplenium_griffithii:0.006549):0.006623,Chrysosplenium_hydrocotylifolium:0.016274):0.001679):0.003361,(Chrysosplenium_microspermum:0.020328,(Chrysosplenium_tosaense:0.008347,Chrysosplenium_flagelliferum:0.007192):0.005487):0.008275):0.004898,(((((Chrysosplenium_maximowiczii:0.008639,Chrysosplenium_pilosum:0.007999):0.001313,(Chrysosplenium_rhabdospermum:0.011224,Chrysosplenium_album:0.009093):0.002491):0.001907,((Chrysosplenium_fauriae:0.004724,(Chrysosplenium_echinus:0.002663,(Chrysosplenium_kiotense:0.003064,Chrysosplenium_nagasei:0.001589):0.003492):5.0E-4):0.002587,Chrysosplenium_macrostemon:0.006504):0.010298):0.00365,(Chrysosplenium_kamtschaticum:0.010371,Chrysosplenium_ramosum:0.011509):0.003164):0.00193,(((Chrysosplenium_nepalense:0.003278,Chrysosplenium_pseudofauriei:0.004664):0.010396,Chrysosplenium_grayanum:0.014905):0.002899,(Chrysosplenium_oppositifolium:0.005424,Chrysosplenium_americanum:0.004706):0.003919):0.005516):0.007065):0.025048):0.004701):0.001503,((((Oresitrophe_rupifraga:0.00261,Mukdenia_rosii:0.002401):0.002424,(((Bergenia_emeiensis:4.72E-4,Bergenia_stracheyi:0.001695):0.001138,((Bergenia_pacumbis:4.7E-4,(Bergenia_crassifolia:0.001999,Bergenia_ciliata:0.001009):3.97E-4):2.69E-4,Bergenia_sp:0.001389):5.57E-4):4.28E-4,Bergenia_purpurascens:0.007798):0.003667):4.63E-4,((Astilboides_tabularis:0.006536,((Rodgersia_aesculifolia:0.00219,(Rodgersia_sambucifolia:4.23E-4,Rodgersia_pinnata:0.002133):8.71E-4):6.76E-4,Rodgersia_podophylla:0.003306):0.002084):0.001024,Darmera_peltata:0.012296):0.006743):0.001103,(Cascadia_nuttallii:0.025718,Saxifragodes_albowiana:0.027448):0.030623):0.001416):5.48E-4):9.27E-4):0.002102,((Leptarrhena_pyrolifolia:0.005985,Tanakaea_radicans:0.007181):0.00373,(Saniculiphyllum_guangxiense:0.018046,(((Sullivantia_oregana:4.05E-4,Sullivantia_sullivantii:5.59E-4):0.007379,((((Boykinia_occidentalis:0.001861,Boykinia_rotundifolia:0.001263):0.002822,Suksdorfia_ranunculifolia:0.010571):0.001399,Boykinia_richardsonii:0.009312):0.001742,(Suksdorfia_violacea:0.007157,Bolandra_oregana:0.00878):0.001194):0.004239):0.002615,((Telesonix_heucheriformis:0.003118,Telesonix_jamesii:7.82E-4):0.001188,Jepsonia_parryi:0.012499):0.002801):0.003569):8.66E-4):8.51E-4):0.00552):0.003882,Saxifragopsis_fragarioides:0.009753):0.002075,Astilbe_myriantha:0.004099):0.001816):0.001118):0.002367,Astilbe_odontophylla:0.003339):-9.82E-4,((Astilbe_rubra:0.001587,(Astilbe_philippinensis:9.02E-4,Astilbe_microphylla:0.024603):0.001282):0.001439,(Astilbe_simplicifolia:8.4E-5,Astilbe_thunbergii:-1.7E-4):0.001143):2.85E-4):0.001045,Astilbe_macrocarpa:0.001319,Astilbe_biternata:0.001353); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr77369] END;